Teaching
Academic year 2022-2023
Academic year 2021-2022
Academic year 2020-2021
Academic year 2019-2020
Academic year 2018-2019
- Mathematical modelling of DNA
- Elastic rods and birods I and II (EDMA doctoral school course)
Academic year 2017-2018
- Analyse III (section de physique)
- Differential geometry of framed curves
- Mathematical modelling of DNA
Academic year 2016-2017
- Analyse III (section de physique)
- Differential geometry of framed curves
- Mathematical modelling of DNA
Academic year 2015-2016
- Analyse III (section de physique)
- Differential geometry of framed curves
- Mathematical modelling of DNA
Academic year 2013-2014
- Analyse III (Section de Physique)
Academic year 2012-2013
- Analyse III (Section de Physique)
- Algèbre linéaire I (SCGC, UNIL SF)
- Algèbre linéaire II (SCGC, UNIL SF)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- Master and semester projects
Academic year 2011-2012
- Analyse III (Section de Physique)
- Algèbre linéaire I (IN, SC)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- DNA modelling
- Master and semester projects
Academic year 2010-2011
- Analyse IV (Section de Physique)
- Calcul scientifique appliqué à l'algèbre linéaire (Section Mathématique)
- Analyse III (Section de Physique)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- Master and semester projects
Academic year 2009-2010
- Analyse IV (Section de Physique)
- DNA modelling
- Analyse III (Section de Physique)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- Calcul scientifique appliqué à l'algèbre linéaire
Academic year 2008-2009
- Equations différentielles ordinaires
- Calcul scientifique appliqué à l'algèbre linéaire (EDOC Math)
- Analyse III (Section de Physique)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- DNA modelling
Academic year 2007-2008
- Equations différentielles ordinaires
- Cours d'Algèbre Linéaire (Section Systèmes de Communication et Section Informatique)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- DNA modelling
Academic year 2006-2007
- Cours d'Algèbre Linéaire (Section Systèmes de Communication et Section Informatique)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- Perturbation theory and asymptotic analysis
Academic year 2005-2006
- Cours d'Algèbre Linéaire (Section Systèmes de Communication et Section Informatique)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- DNA modelling
Academic year 2004-2005
- Cours d'Algèbre Linéaire (Sections Electricité et Informatique)
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- Diploma and semester projects
Academic year 2003-2004
- Cours d'Algèbre Linéaire (Sections Electricité et Informatique)
- DNA modelling
- Mathématiques appliquées (Section Chimie et Génie chimique)
- Algèbre numérique appliquée
- Diploma and semester projects
Academic year 2002-2003
- Modelling Biological Macromolecules (Ecole doctorale : semestre d'été)
- Cours d'Algèbre Linéaire (Sections Electricité et Informatique)
- Travaux pratiques de simulation numérique
- Diploma and semester projects
Academic year 2001-2002
- Cours d'Algèbre Linéaire (Sections Electricité et Informatique)
- Travaux pratiques de simulation numérique
- Second Cycle Course: DNA modelling
- Diploma and semester projects
Academic year 2000-2001
- Cours d'Algèbre Linéaire (Sections Electricité et Informatique)
- Travaux pratiques de simulation numérique
- Equations différentielles ordinaires I
- Second Cycle Course: DNA modelling
- Third Cycle Course: Conformal geometry of curves and surfaces by R. Langevin (University of Dijon, France)
- Diploma and semester projects
Academic year 1999-2000
- Cours d'Analyse III-IV (Section SSC)
- Cours d'Algèbre Linéaire I-II (Sections Electricité et Informatique)
- Travaux pratiques de simulation numérique
- DEA plurifacultaire en bioinformatique
- Diploma and semester projects
Academic year 1998-1999
- Second Cycle Course: DNA modelling
- Travaux pratiques de simulation numérique
- Cours d'Analyse Avancée B
- Diploma and semester projects
Academic year 1997-1998
- Third Cycle Course: Stability in Hamiltonian Systems and the Calculus of Variations/li>
- CAPA Course on Continuum Mechanics Modeling of DNA
- DNA modelling seminar
LCVM2 can propose masters and semester projects to students in mathematics, physics, computer science and life science. If you are interested, please contact John Maddocks. A list of possible topics as well as the list of all previous students projects done in the group are provided below. All the masters projects are available on the publications page.
Possible topics
The following list is given for example and is not exhaustive. You can also check our research page to get a global idea of the group's current interests.
- Analysis of Molecular Dynamic data
- Coarse grain models in DNA mechanics
- Statistical physics of rigid body chain and rods
- Homogenization techniques in rod mechanics
- Cyclization problem in DNA mechanics
- Make the ideal real in knots problems
Previous students projects
This list contains all the students projects done in the group. All the masters projects are also available on the publications page.
| Semester | Student | Project type | Title |
|---|---|---|---|
| 2016-2017 | Christopher Morison | Semester project | Proof of the Calugareanu-Fuller-White Theorem for Non-Adapted Framings |
| 2015-2016 | Armand René Chouzy | Semester project | Fitting helicas to points in 3D |
| 2015-1016 | Dario Marvin | Semester project | Mathematical simulation of DNA |
| Autumn 2012 | Julien Duvanel | Projet de semestre (Ph. Caussignac) | Optimisation de méthodes itératives pour la résolution de systèmes linéaires sur unité graphique (GPU) |
| Spring 2012 | Pauline Rüegg-Reymond | Semester project | Classification of Quadratic Surfaces |
| Autumn 2011 | Pauline Rüegg-Reymond | Semester project | Stability of helical equilibria |
| Autumn 2011 | Etienne Favre and Giacomo Rosilho de Souza | Semester project | Helical Equilibria |
| Spring 2010 | Maxime Mogé | Projet de semestre (Ph. Caussignac) | Algèbre linéaire sur processeur graphique |
| Spring 2010 | Julien Delafontaine | Semester project | 3D modelling and eigenvalues of the stiffnesses of a rigid base model |
| Autumn 2009 | Julien Delafontaine | Semester project | Spectral analysis of a coarse-grain model of DNA |
| Spring 2009 | Linda Frossard | Semester project | Errors Between Different Rotation Parametrizations with Numerical Application to DNA Data |
| Summer 2008 | Simon Kuttruf | Semester project | DNA Modelling |
| Winter 2006/2007 | Daiva Petkeviciute | Semester project | High Twist Asymptotics and DNA Equilibria |
| Winter 2004/2005 | Gilles Steiner | Projet de semestre (Ph. Caussignac) | Etude et experimentation de la methode asymptotique numerique |
| Winter 2004/2005 | Nikki Vercauteren | Semester project | Extracting Macroscopic Dynamics |
| Winter 2004/2005 | Mathias Carlen | Projet de Diplôme de Physicien | Analysis and Simulation of Stokes Flow of Knotted Filaments |
| Summer 2004 | Mathias Carlen | Semester project | Computation and Visualization of ideal knot shapes approximated by biarcs, Part 2 |
| Winter 2003/2004 | Mathias Carlen | Semester project | Computation and Visualization of ideal knot shapes approximated by biarcs, Part 1 |
| Summer 2002 | Christian Schlatter | Semester project | C_alpha circles |
| 2001/2002 | Jérémie Cabessa | Projet de Diplôme d'Ingénieur Mathématicien | Travelling Waves in Planar Double-Strand Rods |
| Winter 2000/2001 | Arnulf Graf | Travail de Diplôme du Certificat de 3ème cycle en Dynamique des Fluides | Dissipation and Shapes of Knotted Curves |
| Summer 2000 | Markus Wistrand | Semester project | Mathematical Models of DNA |
| Winter 1999/2000 | Ivo Bloechliger | Projet de semestre (Ph. Caussignac) | Parallelization of a dense solver on distributed memory machines |
| Winter 1999/2000 | Julien de Siebenthal | Diploma project | Statistical mechanics of polymers and framed curves |
| Summer 1999 | Baraka Driss | Semester project | Floquet Theory for an Elastic Strut |
| Summer 1999 | Julien de Siebenthal | Semester project | Interactive visualization and computation of framed curves II |
| Winter 1998/1999 | Julien de Siebenthal | Semester project | Interactive visualization and computation of framed curves I |